MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623

Total Repeats: 12562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019966	GAC	2	6	146	151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019966	CCGC	2	8	192	199	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_019966	GAA	2	6	285	290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019966	GACA	2	8	333	340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019966	CAC	3	9	382	390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_019966	ACA	2	6	428	433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019966	CGA	3	9	437	445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019966	CTGTC	2	10	446	455	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_019966	GTC	2	6	504	509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019966	TCT	2	6	2048	2053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019966	TGT	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019966	GC	3	6	2100	2105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019966	A	6	6	2114	2119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019966	A	6	6	2125	2130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019966	CAC	2	6	2158	2163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_019966	TCT	2	6	2379	2384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019966	GAA	2	6	2387	2392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019966	CGAT	2	8	2455	2462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019966	GGT	2	6	2493	2498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019966	TTG	2	6	2576	2581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019966	GC	3	6	3827	3832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019966	GCC	2	6	6486	6491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_019966	CGC	2	6	6577	6582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_019966	CGC	2	6	6597	6602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_019966	CAC	2	6	6658	6663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_019966	CGG	2	6	13381	13386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019966	GCA	2	6	13387	13392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019966	GCG	2	6	13420	13425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019966	TCG	2	6	13445	13450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019966	TCC	2	6	13529	13534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_019966	GTC	2	6	13601	13606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019966	CACGG	2	10	13623	13632	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_019966	CGG	2	6	13650	13655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019966	CGA	2	6	13770	13775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019966	TGAA	2	8	13820	13827	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019966	TCA	2	6	13829	13834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019966	CTTG	2	8	14141	14148	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019966	TCG	2	6	14208	14213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019966	CTT	2	6	14222	14227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019966	ACC	2	6	14318	14323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_019966	TCG	2	6	14339	14344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019966	CGG	2	6	14360	14365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019966	GCG	2	6	14408	14413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019966	CA	3	6	14434	14439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019966	GAT	2	6	14448	14453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019966	GACGAT	2	12	14454	14465	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019966	ACTG	2	8	14537	14544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019966	CA	3	6	14607	14612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019966	CCT	2	6	14633	14638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_019966	GCGG	2	8	14696	14703	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019966	CG	3	6	14711	14716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019966	CGT	2	6	14746	14751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019966	CCA	2	6	16638	16643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_019966	CCCG	2	8	17222	17229	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_019966	TGC	2	6	17650	17655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019966	TGA	2	6	17742	17747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019966	CG	3	6	17771	17776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019966	CGA	2	6	18112	18117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019966	GAG	2	6	18166	18171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019966	CA	3	6	18999	19004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019966	CGCT	2	8	22911	22918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019966	CG	3	6	22927	22932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019966	GC	3	6	22935	22940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019966	CCGTCC	2	12	27898	27909	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_019966	CGACG	2	10	27961	27970	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_019966	CCGC	2	8	29460	29467	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_019966	TCG	2	6	29473	29478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019966	GAATC	2	10	29589	29598	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_019966	GTT	2	6	29708	29713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019966	CA	3	6	29796	29801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019966	GA	3	6	29812	29817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019966	T	6	6	29876	29881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019966	CGGC	2	8	29912	29919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019966	CCG	2	6	31736	31741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_019966	CAA	2	6	31769	31774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019966	CGAC	2	8	35939	35946	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019966	GAC	2	6	35996	36001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019966	TGC	2	6	36015	36020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019966	TGT	2	6	36069	36074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019966	AGT	2	6	36114	36119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019966	CAG	2	6	38285	38290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019966	GCC	2	6	38390	38395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_019966	GTT	2	6	38404	38409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019966	TCG	2	6	38729	38734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019966	ACT	2	6	38755	38760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019966	TG	3	6	42582	42587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019966	TAC	2	6	42624	42629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019966	CCG	2	6	45633	45638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_019966	C	6	6	49820	49825	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_019966	CTG	2	6	49839	49844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019966	TGG	2	6	50443	50448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019966	TAC	2	6	51222	51227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019966	CGC	2	6	51310	51315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_019966	ACGG	2	8	51322	51329	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_019966	TGC	2	6	51378	51383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019966	ACCG	2	8	54248	54255	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019966	CG	4	8	54257	54264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019966	CGGT	2	8	54308	54315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019966	CGG	2	6	54319	54324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019966	GGTT	2	8	54353	54360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019966	TCC	2	6	54373	54378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_019966	AGGA	2	8	54386	54393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019966	CACC	2	8	54394	54401	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_019966	CGAG	2	8	61859	61866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019966	GTGG	2	8	61879	61886	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019966	GTGCC	2	10	65190	65199	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_019966	GCC	2	6	65277	65282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_019966	ACT	2	6	66024	66029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019966	CGC	2	6	66031	66036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_019966	GCG	2	6	66167	66172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019966	CTG	2	6	66173	66178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019966	CGTC	2	8	66234	66241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019966	GCT	2	6	66295	66300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019966	TCT	2	6	66306	66311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019966	CTG	2	6	66314	66319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019966	ATC	2	6	66362	66367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019966	CGG	2	6	66378	66383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019966	TCT	2	6	66405	66410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019966	CGA	2	6	66421	66426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019966	CG	3	6	66514	66519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019966	GCG	2	6	66554	66559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019966	CGA	2	6	66587	66592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019966	ACG	2	6	66625	66630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019966	GCT	2	6	66644	66649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019966	GGC	2	6	66650	66655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019966	ACG	2	6	66841	66846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019966	CGA	2	6	66866	66871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019966	CG	3	6	66913	66918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_019966	CGG	2	6	66955	66960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019966	CGA	2	6	67007	67012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019966	CTG	2	6	67083	67088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019966	CGATG	2	10	67097	67106	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_019966	CGC	2	6	67165	67170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_019966	CGT	2	6	68584	68589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019966	CCCG	2	8	68595	68602	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_019966	C	7	7	68607	68613	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_019966	GCG	2	6	68617	68622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019966	CCAAC	2	10	68663	68672	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NC_019966	CGC	2	6	68723	68728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_019966	GAGGC	2	10	68759	68768	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_019966	CGATC	2	10	72907	72916	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_019966	CGGTC	2	10	72930	72939	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_019966	C	6	6	72954	72959	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
144	NC_019966	TCG	2	6	72968	72973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019966	GT	3	6	73019	73024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_019966	GCC	2	6	73051	73056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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149	NC_019966	CGC	2	6	75910	75915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_019966	TCG	2	6	75954	75959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_019966	TCGCA	2	10	202702	202711	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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401	NC_019966	GCC	3	9	265164	265172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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413	NC_019966	CTT	2	6	266784	266789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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419	NC_019966	GCC	2	6	268019	268024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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421	NC_019966	ATC	2	6	268040	268045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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423	NC_019966	CGGCG	2	10	268112	268121	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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430	NC_019966	ACC	2	6	269491	269496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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449	NC_019966	AGG	2	6	278650	278655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_019966	TTG	2	6	278742	278747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
453	NC_019966	GTA	2	6	278792	278797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
454	NC_019966	CGG	2	6	278818	278823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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458	NC_019966	CGC	2	6	280501	280506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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460	NC_019966	TTA	2	6	281828	281833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_019966	CG	3	6	283123	283128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
462	NC_019966	CGG	2	6	284854	284859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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475	NC_019966	CG	3	6	298443	298448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
476	NC_019966	CG	3	6	298478	298483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
477	NC_019966	TGAGT	2	10	302018	302027	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
478	NC_019966	CG	3	6	303641	303646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
479	NC_019966	TCC	2	6	305051	305056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
480	NC_019966	GTC	2	6	305061	305066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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482	NC_019966	GGT	2	6	307424	307429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_019966	GGT	2	6	312505	312510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
490	NC_019966	GAT	2	6	316455	316460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_019966	CCG	2	6	330542	330547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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